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资源与安全学院；煤矿开采技术、矿井通风与安全、环境工程技术、安全技术与管理、职业卫生技术与管理、应用化工技术、药品质量与安全
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艺术设计工程学院；建筑装饰工程技术、园林工程技术、建筑室内设计、视觉传播设计与制作、产品艺术设计、环境艺术设计、人物形象设计
智能制造与交通学院；建筑智能化工程技术、机械设计与制造、数控技术、机电一体化技术、电气自动化技术、工业机器人技术、智能控制技术、汽车检测与维修技术、汽车电子技术、新能源汽车技术、城市轨道交通机电技术
家庭困难的学生可申请国家助学金，每学年对品学兼优的学生学校实行奖学金五年制高职专科学生，前三年按中专标准执行，后两年按联办高校标准收费，中专对学生免学费;五年制高职专科学生，前三年按中专标准执行，后两年按联办高校标准收费
学校创办于1951年10月，原校址在重庆北碚沙坝，校名为西南工业部采煤专业学校，隶属西南煤管局领导。
1952年，正式招生，初期规模600人，设高采班、中采班、会计统计班。
1954年1月，学校由天府沙坝迁至重庆沙坪坝区上桥，更名为燃料工业部重庆煤矿学校。
1957年7月，更名为重庆煤矿学校，改由四川煤管局领导。
1966年至1971年，因“文化大革命”停止招生。1972年恢复办学，在煤矿职工和下乡、回乡知识青中年推荐招收学生。
1977年，按国家计划统一招收参加高考的高中毕业生。
1982年5月，实行部与省双重领导，以部为主的管理体制。1984年5月起用重庆煤炭工业学校。
1997年3月，更名为重庆工程技术学校，同年8月其主管部门由四川煤管局划转重庆煤管局管理。
1998年，经重庆市人民政府批准，试办初中后五年制高等职业技术教育班。
1998年8月，煤炭部撤消，学校由重庆煤管局主管。
2001年3月，经重庆市人民政府批准，国家教育部备案，学校升格为职业技术学院并更名为重庆工程职业技术学院，直属重庆市煤炭工业局，开始招收高中后三年制高职。
2004年，被教育部、建设部确认为国家建设类技能型紧缺人才培养试点高校。
2004年12月9日，学校由重庆市煤炭工业局划转重庆市教育委员会管理。
2005年，学校通过教育部高职高专人才培养工作水平评估，荣获优秀等级。
2010年，通过教育部、财政部验收，学校被批准为国家示范性高等职业院校。
2014年，学校整体由沙坪坝区上桥校区、巴南区走马校区搬迁至江津区滨江新城新校区。
2018年2月，与重庆师范大学、重庆科技学院联合开办“3+2专本贯通分段培养”本科专业5个。
2019年7月，被教育部认定为国家优质专科高等职业院校。
2019年12月，被教育部、财政部列入第三类高水平专业群建设单位（B档）。
2020年7月，学校获批与重庆文理学院联合培养机械电子工程专业两年制“专升本”本科学生。
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